Profesor del Departamento de Estudios Semíticos de la Universidad de Granada desde el año 1989, pasó el grueso de sus años como profesor universitario, jubilándose, tempranamente, en septiembre de 2003. Se formó en varios campos y centros. Realizó estudios de Humanidades y Filosofía en el Seminario de San Fulgencio (Murcia), de Teología en la Universidad Gregoriana (Roma), de Ciencias bíblicas en el Pontificio Instituto Bíblico (Roma) y los estudios en Filología Semítica en la Universidad de Barcelona. En la Universidad Complutense de Madrid continuó su formación comenzando la tesis bajo la dirección del Prof. Alejandro Díaz Macho con el tema de
Tradiciones Mesiánicas en el Targum Palestinense. Estudios Exegéticos. Aunque pronto abandonara la universidad por el trabajo pastoral, nunca estuvo deltodo fuera de ella como no lo estuvo de la actividad investigadora. Su vuelta a la universidad se produce con su incorporación a la Facultad de Teología de Granada y que pronto compagina con la dirección del Instituto español bíblico y arqueológico (Casa de Santiago) en Jerusalén, institución muy ligada a la Universidad Pontificia de Salamanca.
A lo largo de estos años ven la luz tres ediciones de textos rabínicos:
Los Capítulos de Rabbí Eliezer. Versión crítica, introducción y notas, en 1984,
Parábolas Rabínicas. El Ma?al Midrásico o el
Ma?al como recurso hermenéutico para abrir la Escritura. Ensayo sobre los Me?alim del Midrás Sifre Números en 1988 y
Midrás Sifre Números. Versión crítica, introducción y notas en 1989. A ellos hay que sumar sus colaboraciones en prestigiosas revistas, entre otras, Estudios Bíblicos y Sefarad. En el año 1987 se incorpora al Dpto. de Estudios semíticos como profesor titular interino del Área de hebreo y arameo de la Universidad de Granada. Un año más tarde es Titular funcionario y en 1992 obtuvo la Cátedra de Universidad. Se adhirió desde sus principios en la Asociación Española de Estudios Hebreos y Arameos, de la que fue presidente. También es miembro de la Asociación Bíblica Española y del comité ejecutivo de la European Association for Jewish Studies. Fruto de su actividad como docente y junto al también Profesor Julio Trebolle, Trotta ha publicado el libro-CD "Historia de la Biblia" (2006).